Kraujo centro veikla yra reglamentuota Lietuvos Respublikos įstatymais, Sveikatos apsaugos ministro įsakymais, Všį Vilniaus universiteto ligoninės Santariškių klinikų įsakymais ir nuostatais. Taip pat vadovaujamasi Europos Sąjungos reglamentais ir geros medicininės praktikos principais.